اتساقًا مع رؤية ورسالة جامعة الزعيم الأزهري وأهدافها الاستراتيجية تم  إنشاء وحدة التعليم الإلكتروني في العام 2013 م كجزء من الجهد المتواصل للجامعة في تبني أحدث الطرق العلمية في سبيل تطوير العملية التعليمية.